Характеристика виромов оз. Байкал с применением высокопроизводительного секвенирования

Характеристика виромов оз. Байкал с применением высокопроизводительного секвенирования

Февраль — декабрь 2021

Вирусы – самые многочисленные биологические объекты в водных экосистемах. Они влияют на многие биогеохимические и экологические процессы. Так как вирусы могут вызывать очаги инфекции, поиск потенциально опасных вирусов современными методами является неотъемлемой частью мониторинга экосистем. При этом среди исследований виромов (вирусных сообществ) до сих пор немногочисленны работы по пресным озёрам.

Проект Фонда «Озеро Байкал» направлен на проведение оценки генетического и таксономического разнообразия, а также структуры вирусного сообщества в пелагиали оз. Байкал с помощью высокопроизводительного секвенирования и биоинформатических методов.

Исследования проводятся под руководством Потапова Сергея, победителя конкурса для молодых ученых «Байкальская инициатива». 

Цель:

  • Выявить генетическое разнообразие вирусов в оз. Байкал, определить их таксономический состав и соотношение таксонов, пополнить базу виромных исследований из пресных озёр, выявить потенциально опасные группы вирусов.

Задачи:

  • Оказать грантовую поддержку Лимнологическому институту Сибирского отделения Российской академии наук на реализацию проекта;
  • В рамках грантовой поддержки провести следующие работы в 2021 году:

1) провести генетический анализ разнообразия вирусов озера Байкал с помощью высокопроизводительного секвенирования и биоинформатических методов;

2) выполнить оценку генетического и таксономического состава, структуры вирусного сообщества в пелагиали оз. Байкал в осенний период, провести его сравнительное изучение с виромами, полученными ранее и из других водоемов;

3) выполнить оценку вирусных сообществ оз. Байкал с точки зрения содержания потенциально опасных вирусов, проанализировать возможную угрозу биологического загрязнения биоты озера путем попадания микроорганизмов антропогенного происхождения из сточных вод.



Сохранение водных ресурсов