Исследование функциональных особенностей P-gp эндемичных байкальских амфипод с использованием трансфицированных клеточных линий

Исследование функциональных особенностей P-gp эндемичных байкальских амфипод с использованием трансфицированных клеточных линий

Февраль — декабрь 2020

Одной из наиболее актуальных проблем в современном мире является масштабное загрязнение пресноводных экосистем. Мониторинг антропогенного прессинга на водоёмы и поддержание надлежащего качества питьевой воды, требует непрерывного совершенствования методов контроля. На сегодняшний день в условиях возрастающего хозяйственного развития Байкальского региона остро стоит проблема создания быстрых и эффективных методов экологического мониторинга озера Байкал. Токсическое загрязнение на фоне глобальных климатических изменений может принести существенный урон жизнедеятельности байкальских гидробионтов.

Исследования будут проводиться под руководством Лубяги Юлии, победителя конкурса для молодых ученых «Байкальская инициатива». Будут проведены токсикологические испытания на клеточных линиях амфипод, которые позволят впоследствии применить данные технологии в экспресс-оценке токсичности потенциально опасных веществ, попадающих в воды озера, прогнозировать последствия антропогенного воздействия на Байкал и других водоемов.

Цель:

  • Изучить функциональные и структурные особенности p-гликопротеина (P-gp) байкальских эндемичных амфипод с применением трансфицированных клеточных линий.

Задачи:

  • Оказать грантовую поддержку Иркутскому государственному университету (ФГБОУ ВО «ИГУ») на реализацию соответствующего проекта;
  • в рамках грантовой поддержки провести следующие работы в феврале-декабре 2020 года:

1) провести исследования на клеточных линиях Drosophila melanogaster;

2) провести детальный анализ последовательности P-gp эндемичных байкальских амфипод с дальнейшим определением его структуры и построением трехмерной модели белка при помощи современных компьютерных программ;

3) провести сравнительный анализ последовательностей гена P-gp амфипод и белковой структуры с представителями других видов;

4) выявить локализацию белка в различных тканях амфипод методами электрофореза с последующим вестерн блоттингом;

5) выявить функциональные особенности амфипод методами измерения поглощения специфического флуоресцентного субстрата в присутствии ряда химических веществ;

6) определить значения IC50 для ряда потенциально опасных для байкальских организмов токсических веществ, а также определить диапазон допустимых концентраций и выявить степень токсичности веществ в анализах цитотоксичности. 

Вывод ученых:

В результате выполнения проекта будут получены данные, необходимые при создании методик экологического мониторинга. Также, будут отработаны методики проведения цитотоксических тестов для оценки потенциально опасных для экосистемы озера веществ. Впервые будет получена информация о структурных и функциональных характеристиках белка транспортёра байкальских организмов.



Сохранение водных ресурсов